Будущий покоритель космоса родился 27 июля 1946 года в семье кузнеца Онгарбая. Вместе с матерью Камилей и двумя сестрами парень жил в селе при колхозе имени Первого мая в Карагандинской области. Данное мальчику имя неслучайно. Оно походит от слова «тоқта», что переводится как ‘остановиться’. Так по традиции называют детей, появившихся на свет после ряда выкидышей или нескольких подряд рожденных девочек. Имея за спиной восемь классов школы, Токтар в 1962 году устроился токарем на завод в Темиртау. За год до этого страну всколыхнул подвиг Юрия Гагарина, который совершил первый полет в космос. Тысячи мальчишек мечтали повторить его опыт, и Токтар не был исключением. В отличие от большинства юноша не витал в облаках, а уверенно шел к своей мечте. Поэтому параллельно с работой он посещал вечерние занятия, чтобы получить полное среднее образование. Кроме того, в 1961 году Токтар получил третий разряд по парашютному спорту, а еще через три года записался в летный учебный центр. Завершив обучение в вечерней школе, Аубакиров пошел в армию. Во время службы Токтар окончил авиационный вуз в городе Армавир и получил специальность «летчик-инженер». Уволившись в запас, капитан Аубакиров продолжил учебу в школе летчиков-испытателей имени Федотова. С 1976 по 1990 год работает по специальности на авиазаводе в Улан-Удэ и ОКБ им. Микояна, продолжает учебу в Московском авиационном институте, где получает диплом инженера в сфере аэрогидромеханики. За пятнадцать лет работы летчиком-испытателем Токтар Аубакиров неоднократно рисковал жизнью, проверяя летные качества более пятидесяти различных типов самолетов. В основном это были военные летательные аппараты: МиГ-27. МиГ-31Б. МиГ-23. МиГ-25. МиГ-29К. На перехватчике МиГ-31Б Токтар Аубакиров совершил первый полет на Северный полюс без посадки. В рамках этого испытания проводили проверку систем воздушной дозаправки.
Популярные вопросы