Некоторые фотосинтезирующие организмы, например, комнатное растение колеус, бурая водоросль ламинария, хламидомонада снежная, создающая эффект «красного снега», не окрашены в зелёный, традиционный для хлорофилла, цвет. Такую окраску можно объяснить следующим: У этих организмов накапливаются особые хлорофиллы, окрашенные в красный или бурый цвет, при которых они и фотосинтезируют.

Эти организмы фотосинтезируют лишь в течение небольшой части своего жизненного цикла, когда бывают зелёными. Всё остальное время они находятся в состоянии покоя, без хлорофилла.

У этих организмов основным пигментом, участвующим в процессе преобразования энергии солнечного света в химическую энергию, является не хлорофилл, а другие красные или бурые пигменты (фикобилины, каротиноиды).

У этих организмов присутствие хлорофилла незаметно из-за наличия каротиноидов или фикобилинов.